건국대학교 조쌍구 교수(첨단바이오공학부) 연구팀이 줄기세포의 노화를 지연시키고 조직 재생 능력을 향상시킬 수 있는 신규 DDR1 표적 화합물을 개발했다고 24일 밝혔다.
이번 연구는 동국대학교 약학대학 이경 교수 연구팀과 미국 코넬대학교 의과대학(Weill Cornell Medicine) 연구진이 참여한 국제 공동연구다. 연구 결과는 약리학·약학 분야 상위 5.3% 이내의 국제학술지인 ‘Biomedicine & Pharmacotherapy’에 게재됐다.
DDR1(Discoidin Domain Receptor 1)은 세포 신호 전달과 조직 재생, 세포 노화 조절에 관여하는 단백질이다. 연구팀은 컴퓨팅 기반 분자 설계(CADD) 기법을 활용해 DDR1을 선택적으로 억제하는 신규 화합물 ‘AC-4067’을 발굴했다.
연구팀은 구조 기반 가상 스크리닝과 분자동역학 시뮬레이션 및 자유에너지 계산 등을 통해 DDR1의 결합 구조를 정밀하게 분석하고, 구조-활성 상관관계(SAR) 최적화를 거쳐 후보 물질을 도출했다고 설명했다.
개발된 AC-4067은 DDR1에 대해 IC₅₀ 30.9 nM 수준의 높은 저해 활성을 보였고, 유사 단백질인 DDR2 대비 약 18배의 선택성을 나타냈다. 해당 화합물을 제대유래 중간엽 줄기세포(WJ-MSC)에 적용한 결과 세포 증식과 이동 능력이 증가하고 상처 치유 능력도 유의하게 향상되는 효과가 확인됐다고 전했다.
또한 신규 개발 물질에서 세포 노화 지표인 SA-β-gal 활성 감소와 DNA 손상 지표(γ-H2AX) 감소가 함께 나타나 줄기세포의 복제 노화를 억제하고, 기능적 상태를 보다 젊게 유지하는데 기여하는 것으로 확인됐다.
연구팀 관계자는 “이번 연구는 DDR1 표적 저해제를 통해 줄기세포 노화를 억제하고 조직 재생 기능을 향상시킬 수 있음을 입증한 것”이라며 “AI 기반 신약 설계와 줄기세포 재생의학을 결합한 역노화 치료 전략 개발에 중요한 기초 자료가 될 것으로 기대한다”고 말했다.